Οι Μονάδες Παροχής Εξειδικευμένων Υπηρεσιών του Ελληνικού Ινστιτούτου Παστέρ δημιουργήθηκαν, αναπτύχθηκαν και υποστηρίζονται από τα ερευνητικά εργαστήρια. Λειτουργούν ως τεχνολογικές πλατφόρμες παρέχοντας υπηρεσίες όχι μόνο στους ερευνητές του ΕΙΠ αλλά και σε ερευνητές των Πανεπιστημίων, των Ερευνητικών Κέντρων, των ιδιωτικών Φαρμακευτικών Βιομηχανιών, στον εθνικό και διεθνή χώρο κατόπιν σύναψης συνεργασιών και  ειδικών συμφωνιών ή συμβολαίων.

• Μονάδα Αναπαραγωγής και Διάθεσης Πειραματοζώων
• Μονάδα Διαγονιδιακής Τεχνολογίας
  
• Μονάδα Οπτικής Μικροσκοπίας